學習障礙的病因不明。這些障礙可能不是單一的神經受損造成的，而可能是由於幾個大腦區域無法一起協調工作造成的。
人們對閱讀障礙病因的知識要比其他學習障礙的病因多一些。結構性和功能性的磁共振掃瞄研究和正電子發射斷層掃瞄（PET）的研究已經明確了對閱讀很重要的幾個大腦區域（Shaywitz et al.，2007）（見圖12-3）。然而，為什麼孩子有異常的腦功能尚不完全清楚，遺傳似乎發揮了重要作用。同卵雙生子閱讀障礙的同病率是71%，異卵雙生子閱讀障礙的同病率是49%（Castles et al.，1999）。雖然存在一些變異，但雙親中一位患有閱讀障礙，那麼孩子也患閱讀障礙的比率在23%～65%（Scarborough，1990）。有關閱讀障礙的生物學基礎還有很多尚未瞭解，但可以明確的是，這種疾病不會僅由單一基因遺傳，它很可能是由一些基因共同導致的。
圖 12-3 與閱讀障礙有關的大腦區域
閱讀是一個複雜的過程，涉及大腦的很多區域。
資料來源：Shaywitz,S.，Overcoming Dyslexia：a new and complete science-based program for reading problems at any level.New York：Alfred A.Knopf，2003，p.34，Copyrightc2003 Sally Shaywitz.Reprinted by permission of the publisher.