隨著費登奎斯對中風患者積累了更多的經驗，他開始接觸腦癱兒童，不少孩子在子宮內就中過風，或是出生時大腦缺過氧。這樣的孩子往往無法控制自己的舌頭和嘴唇，說不了話。和中過風的成年人一樣，腦癱兒童大多有著僵硬或「痙攣」的四肢，肌肉太過緊張，使他們僵硬得無法正常行動，甚至完全無法行動。
兒童身體的僵硬帶來了嚴重的問題。剛出生時，我們尚未形成高度發達、差異化的大腦映射圖，感知並做出單個的微妙動作。一個健康的新生兒會把自己的拳頭放在嘴裡吸吮，而未經分化的大腦手部映射圖啟動放電，處理相應的感覺和動作。隨著時間的推移，孩子會從手分化出單根手指，並吸吮手指（比如單獨的拇指）。當他玩耍自己的手，大腦的手部映射圖就開始分化，為每根手指形成不同的區域，分別感知、分別移動。但腦癱的孩子四肢或身體痙攣，無法做出細微、獨立的動作；他的肢體太過僵硬。通常，他的手會變成一個緊握的拳頭，所以他甚至無法讓大腦映射圖為每一動作發育、分化出單獨的區域。
腦癱兒童常見的另一個症狀是，由於小腿肌肉收縮拉起腳跟，他站立時腳跟無法著地，要不就需要由成年人扶著才能保持站立姿勢。因此，他的跟腱總是處於緊張狀態。還有些腦癱孩子膝蓋內翻：大腿內側的肌肉內轉肌始終緊繃，把膝蓋扯到一起。這兩種情況都可能極為痛苦。
主流醫學治療採用手術來解決此類病例。外科醫生切開並延長跟腱。也有時，會給患者注射肉毒桿菌來麻痺肌肉，釋放緊張。但是肌肉收縮始終持續，所以必須反覆手術或注射。對於膝蓋內翻八字腳的孩子，醫生會切斷他們的內轉肌，減輕壓力。但是這些善意而激烈的做法，並未從根本上解決問題，因為是大腦啟動發射信號要肌肉收縮的。此外，手術還讓孩子終生身體力學異常。其他治療方法包括各種伸展運動，認為肌肉和結締組織變短卡住了，沒錯，這是事實。可這些伸展往往非常疼痛，而且也沒有解決大腦「告訴」肌肉要收緊的情況。
費登奎斯認為，痙攣不僅是大腦最初受到的損傷所致，也是大腦調節感知和機動性活動出了問題，因為它沒有得到分化的輸入。所以，大腦不「知道」什麼時候關閉運動皮層的啟動放電。
有一次，在多倫多授課時，費登奎斯遇到了一名腦癱男孩。恩菲拉姆（Ephram）無法正常行走，需要依靠帶輪子的助行器，而且非常痙攣僵硬。因為腳後跟踩不到地，他只得用腳趾走路。但他最迫切的問題是，他的膝蓋緊緊鎖在一起，無法分開。外科醫生已經安排了手術，要切斷他的內轉肌，好撬開其膝蓋。
費登奎斯開始解決腳趾走路的問題。他讓恩菲拉姆躺著，在男孩的腳上做細微的動作，接著又在腿上這麼做，幫助男孩為這些肢體部位分化大腦映射圖。只用了很短的時間，男孩就開始放鬆，呼吸更輕鬆了。費登奎斯利用恩菲拉姆腳和腿上的感覺神經元，把消息發送到孩子的大腦。有了這一輸入，男孩的大腦得以區分腳趾和肌肉，小腿和大腿肌肉，以及它們分別能做哪些動作。只有大腦能做出這些區分，它才能夠開始恰當地調節運動系統神經元的啟動放電和肌緊張。
在功能整合課上，如果費登奎斯感覺到學員肌肉「挺直」或者緊張，他往往會幫學員完成紊亂的神經系統矯枉過正的事情。卡爾·金斯伯格（Carl Ginsburg）是費登奎斯培訓出來的一個機敏治療師，他曾描述說，費登奎斯並不要求學員別再「繃得太緊」，而是幫學員支撐起來。「費登奎斯從對習慣的認識出發，並不反對學員的行為，而是直接將該行為接管過來，代為支撐。費登奎斯發現，只要學生得到最大的支撐，便會放棄習慣性的動作。」[1]
費登奎斯讓恩菲拉姆的膝蓋交叉，把它們合得更攏。費登奎斯所做的，就是紊亂的神經系統「做得過了頭」的事情：教導男孩的神經系統不用幹得這麼努力。幾分鐘後，費登奎斯沒怎麼用力，恩菲拉姆痙攣的大腿肌肉就鬆弛下來。現在，男孩的膝蓋些微分開，費登奎斯把拳頭放進去，讓男孩用大腿內側肌肉擠壓他的拳頭。接著，恩菲拉姆的肌肉徹底鬆開了，膝蓋也完全打開。「你看，打開膝蓋容易得多了吧？」費登奎斯說，「合上膝蓋要用力。」他運用恩菲拉姆的身體來為大腦編程。2006年一次有36名受試者參加的研究顯示，跟拉伸一樣，動中覺知課程也可以拉長肌肉，這種方法運動員們或許可以好好想一想。[2]