2004年2月，惡名昭彰的照片已在軍方高層及犯罪調查單位間流傳，桑切斯將軍被迫採取比賴德的漂白工作更積極的行動。他指派了安東尼奧·塔古巴少將針對虐囚說法、未被列入記錄的囚犯逃脫事件，以及普遍的軍紀廢弛、無人當責等現象進行更完整的調查。塔古巴的工作成果十分令人讚賞，他在2004年3月發表了一份詳盡周延的調查報告。儘管這份報告原本希望維持機密，但因報告內容對廢弛職務的軍官提出直接指控並含有做證據的「那些照片」，新聞價值太高，最後還是被洩露給媒體(或許還賣了一大筆錢)。
塔古巴報告被洩露給《紐約客》，由赫什撰寫的封面故事揭露了這篇報告的主要發現和照片，不過同一批照片在稍早前被洩露給《六十分鐘Ⅱ》的製作人，並在2004年4月28日的節目中播出(讀者應該會回想起，我就是從這裡開始這段旅程)。
塔古巴沒有浪費時間駁斥他的將領同僚的報告。他寫道(強調部分由我加上)：「不幸的是，許多在(賴德的)評估報告中已呈現出的系統性問題正是這次調查的主要對象。」「事實上，許多受拘留者受虐事件發生於該評估報告進行期間，或是接近該期間。」報告中繼續說道，「與賴德少將的報告相反的是，我發現隸屬第372憲兵連、第800憲兵旅的人員的確被指示違反監獄設施規定，為軍情人員的訊問工作進行『預備工作』。」他的報告清楚指出陸軍情治單位長官、中情局探員、私人包商和其他政府機構人員「主動要求憲兵衛軟化證人的身心狀態，以便有利於進行證人訊問工作」。
為了支持這個主張，塔古巴引用了數名獄卒的宣示證詞，其中提及了軍方情治人員和訊問者的串謀角色：
專業軍士薩布裡納·哈曼，第372憲兵連，曾在宣示證詞中陳述某個虐待事件，事件中一位受拘留者被安置在一個箱子上，手指、腳趾和陰莖都被纏上電線，她說：「我的工作就是要讓那個人犯保持清醒。」她說軍情人員曾和下士格拉納交談。她宣稱，「軍情人員希望讓他們招供。格拉納和弗雷德裡克的工作就是協助軍情人員和其他政府機構讓人們招供。」
塔古巴也引用來自傑弗·戴維斯中士的證詞，他提到他觀察到軍情人員和其他政府機構對憲兵獄卒的影響：
「我親眼見到在軍情人員控制下的1A院區中發生許多我會質疑其道德正當性的事情。在1A院區裡，我們被告知這裡對囚·犯待遇的規定和標準操作程序都和別的地方不同。但我從沒看過那地方的任何規定或標準操作程序，都是空口說白話毫無根據可言。負責管理1A院區的士兵是格拉納下士。他說官員代表和軍情人員會叫他做些事，但都不是明文規定，他抱怨(原文照引)。」當被問別為何1A跟1B院區的規定跟其他院區不同時，戴維斯中士的陳述是，「其他院區關的都是一般囚犯，只有1A跟1B是由軍情人員控制的。」當被問到為何他沒有告知他的上級指揮鏈發生虐行的事，他聲稱，「因為我認為如果他們做的事跟平常不同或是有不合乎規定的地方，一定會有人出來說話。(不為之惡再次發揮了作用)而且那個院區歸軍情人員管轄，而看起來軍情人員是容許這些虐待行為。」戴維斯中士也聲稱他曾聽到軍情人員用迂迴的方式暗示獄卒們虐待人犯。當被問到軍情人員的談話內容時，他說：「幫我們讓迷人軟化下來。」「今晚絕不要讓他好過。」「讓他吃點苦頭。」他聲稱聽到這些話被交代給格拉納下士和弗霄德裡克中士。最後戴維斯中士陳述道(原文照引)，「就我所知，軍情人員稱讚過格拉納在軍情人員支配院區的管理方式。比方他們說，做得好，他們很快就招了，他們有問必答，最後招了不少好情報，還有繼續保持下去啊，一類的話。」
第372憲兵連的專業軍士傑森·肯內爾(Jason Kennel)向塔古巴做的陳述勾起我們對斯坦福監獄實驗的回憶，當時獄卒為了懲罰違規行為把囚犯們的床墊、床單、衣服、枕頭全部沒收走；肯內爾是這麼說的：
「我看到他們一絲不掛的，軍情人員叫我們把他們的床墊、床單和衣服通通收走。」他記不得是軍情人員裡面哪個人叫他這麼做的，但是他的意見是，「如果他們要我那樣做，他們就得給我公文。」而後來他被告知「我們不能做任何讓犯人感到尷尬的事」。
於是我們看見，一方面該院區的軍情人員和其他政府單位以非官方方式慫恿憲兵虐待受拘留者，另一方面則是虐待情境的現實，兩者間不一致的情形持續存在，以上所述不過是其中一例。指揮鏈一方面開口下達虐待的指令，另一方面卻在官方公開聲明中強調「我們絕不寬容虐囚行為或任何非人道待遇之行為」。借助這樣的方式，他們便有理由在之後假裝毫不知情似的推卸責任。
塔古巴報告中特別指出，最高層軍方將領在得知這些極端虐行後曾建議進行軍法審判，後來卻未貫徹執行。由於他們對虐待行為知情在先，他們的不為便強化了一個印象，讓人以為虐待囚犯可以不需要付出代價。