2003年6月，美國任命了一位新官員負責管理形同災難的伊拉克監獄。後備役准將賈尼斯·卡爾平斯基(Janis Karpinski)成為第800憲兵旅旅長，負責管理阿布格萊布監獄及所右其他在伊拉克境內的軍事監獄，這項任命十分奇怪，理由有兩點，其—，卡爾平斯基事戰場上唯一的女性指揮官，其二，她完全缺乏經營監獄系統的經驗。而現在她必須指揮三座大型監獄和位於伊拉克各地的17座監獄、八個營的士兵、數以百計的伊拉克獄卒、3400名毫無經驗的後備役軍人，以及位與1A層級的特殊訊問中心。對於一個經驗不足的後備役軍官而言，這項忽然落在肩頭上的任務實在是太過沉重。
根據數個消息來源說法，卡爾平斯基很快就因危險性及生活條件惡劣而離開她在阿布格萊布的駐地，撤退到位於巴格達機場附近、安全性及防禦性較佳的勝利背地(Camp Victory)。由於大多數時候卡爾平斯基都不在阿布格萊布監獄裡，並經常前往科威特，因此該監獄缺乏由上到下，來自官方的日常監督管理。此外，她也聲稱指揮層級更高的人士曾告訴她，lA層級院區是個「特別的地方」，不在她的直接管轄範圍內，因此她從來也沒造訪過那裡。
由於整座監獄只是由—位女性在名義上負責管轄，這也助長了士兵之間的性別歧視態度，並導致一般軍隊紀律和秩序的瓦解。「卡爾平斯基將軍在阿布格萊布的屬下有時會無視於她的指揮，不遵守著軍服及向上級致敬的規定，這讓整座監獄紀律廢弛的情形更加惡化。」一位隸屬該旅的成員這麼說，這名匿名發言的軍人也說戰場上的指揮官習慣不把卡爾平斯基將軍的命令當回事，理由是他們不必聽從一個女人的話。
令人難以理解的足，阿布格萊布的情況如此惡劣，卡爾平斯基將軍在2003年12月接受《聖彼得堡時報》(St. Peterburg Times)的訪談時，卻對此大加讚揚。她說對許多囚禁在阿布格萊布監獄的伊拉克人而言，「監獄裡的生活比住在家裡還舒服。」她還說，「我們有時候還擔心他們不想走呢。」卡爾平斯基將軍在聖誕節前夕的一個訪談中發表了如此興高采烈的看法，然而就在此時，少將安東尼奧·塔古巴(Antonio Tagubo)卻正在進行一份調查報告，內容是關於多件「殘酷、露骨、肆無忌憚的犯罪虐行」，加害者正是卡爾平斯基在第372憲兵連的後備役軍人，來自1A層級院區的值夜獄卒。
卡爾平斯基將軍後來因此事受到申誡、停職以及官方譴責，並被免去該項職務。她也從准將被降級上校並提前退職。她是第一位也是唯一一位在虐囚調查中被認為必須受到譴責的官員，原因是她的疏忽及對此事毫無所知——不是因為做了什麼事，而是因為她沒做的事而受到譴責。
在她的自傳《女人從軍記》(One Woman』s Army)中，卡爾平斯基從她的立場提出另一種說法。她敘述由傑弗裡·米勒(Geoffrey Miller)少將率領、來自關塔那摩的軍事團隊來訪時發生的對話，米勒少將告訴她，「我們來這裡的目的是要改變阿布格萊布這裡的訊問方法。」意思就是「不必客氣」，對於這些暴動嫌疑分子無須手下留情，而且要運用一些手段取得「可起訴的情報」，好在這場對付恐怖分子和暴動分子的戰爭中派上用場。
米勒也堅持將監獄的官方名稱從巴格達中央監獄改回原名，因為伊拉克人民對阿布格萊布監獄這名稱的恐懼感仍未消除。
她也提到美國駐伊拉克軍事指揮官裡卡多·桑切斯中將也曾針對囚犯和被拘留者做出和米勒少將同樣的發言，他說他們「跟狗一樣」，對付他們需要拿出更嚴厲的手腕。在卡爾平斯基的看法中，她的上級長官，也就是米勒和桑切斯將軍制定了一套新辦法，目的是在阿布格萊布監獄中從事去人性化及拷問工作。