我們能注意到，差異的能力很重要。但這種看上去單純的要求造成了一個問題，這個問題的重要性從來沒有在心理學界得到認可。要理解難點所在，讓我們回到思維重新佈置的主題上來。我們首先假設問題是比較兩個不同的智能組中表述的兩種房間佈置：智能組A表述的房間裡有一個沙發和一把椅子；智能組Z表述的是同一個房間，但沙發和椅子交換了位置。
現在，如果兩個智能組表述傢俱佈置的方式都要讓某個第三方智能組D可以進行比較，那麼「差異探測」智能組D就必須接收兩套幾乎完全匹配的輸入。否則，A和Z的輸出之間每個其他不相關的差異對D來說都是那兩個房間的差異，這樣D會察覺到許多偽差異，而那些真正的差異卻無法被識別出來！
副本問題（the duplication problem） 。除非兩個智能組本身實際上是完全相同的，否則它們的狀態之間無法進行比較。
但這只是冰山一角，因為如果要對兩種描述進行對比，那麼它們就算來自幾乎一樣的智能組也還是不夠。反過來，那些智能組接收的輸入信息還必須具有幾乎一致的特徵。要實現這一點，它們的每個次級智能組都必須滿足同樣的約束條件。要滿足所有這些要求，唯一的方法就是讓兩個智能組，以及它們所依賴的所有次級智能組完全一致。除非能找到其他的方式，否則我們將會需要無數的頭腦副本！
這個副本問題總是會出現。當你聽到瑪麗買了約翰的房子時會發生什麼？一定要有單獨的智能組同時把瑪麗和約翰記在思維中嗎？就算是這樣也不夠，因為除非兩個表述人的智能組與其他智能組都具有相似的聯結，否則那兩種對「人」的表述就不會具有一樣的含義。在你把當前的情境與某種回憶或經驗進行比較，也就是比較自己如何對兩種不同的思維狀態做出反應時，也一定會出現同樣的問題。但要比較這兩種反應，需要什麼樣的同步機器來維持兩種臨時的人格呢？一個單一的思維如何能夠保留兩個空間，一個給新人，一個給舊人呢？