基因史
傳統上，基因學家們通過追蹤基因的流動來研究人口的起源和轉移。他們研究Y染色體的特定變異，從而確定亞洲的哪一支族群跟美洲印第安人血緣最為接近。[1]他們嘗試確定在多大程度上現代歐洲人衍生自舊石器時代早期那些採用了農業的古代歐洲居民，又有多大程度起源於新石器時代從中東遷來的移民。[2]研究者還利用線粒體DNA（mtDNA）和Y染色體的數據來尋找某個混血群體的父系和母系祖先——例如，他們發現大多數墨西哥人的Y染色體來源於西班牙人，而其線粒體DNA則來自美洲印第安人。[3]他們也嘗試用這種方法分析其他古代的人口流動，尤其是人類首次走出非洲的壯舉。
有兩種視角可以看待這些特定基因變異類型提供的信息。第一種，在目的為確定父系和母系源流的分析中，研究者的興趣只在於這些基因變異標示了怎樣的人口流動和混合過程，而不關心這些基因變異本身的功能。他們假定每個Y染色體的功能是一樣的，所有線粒體DNA的變異也具有同樣的性質：換句話說，它們是中立的。可是，如果它們的性質有所區別，比如說，假使某些Y染色體變異的攜帶者會比其他種類變異的攜帶者有顯著的體格上的優勢，整個這種傳統分析方法就應該被質疑，尤其是被用於回溯到久遠的史前時代。
我們採取第二種視角，關注等位基因的效用，正因為這些效用有實質上的區別。總體而言，我們關注的是人口的流動和混合怎樣推動新的、更具適應性的變異傳播，而不再考慮怎樣利用這些變異來幫助我們追蹤人口流動。
每一種新的突變都始於一個個體身上的一次複製，任何罕見但是卻有益的重要突變都不例外。它是個別的。如果它想變得重要，以至於能影響全體人類中的相當大一部分，它首先必須得到傳播。從全局來看我們可以理解，只有通過廣泛傳播，那些在最近促使人類進化加速的大批有益突變才能夠起效。假定我們的理論是正確的話，許多這樣的突變正在橫掃世界人口的大部分，這意味著在今天，一個普通人身上也攜帶了大量這種新的有益基因。很可能你跟你幾千年前的祖先在基因構成上已經有顯著差別。儘管自然選擇幾乎不可能總是朝著對我們有利的方向進展，許多的適應性變化仍然帶來了積極的效果。不管怎麼說，我們的物種還在欣欣向榮地發展。