《申報》館印的《聚珍版叢書》，現在已成為稀有之本，藏書家很為重視。那時《申報》館除發行報紙外，曾仿清乾隆用活字所排的聚珍版，用木質活字刊行《聚珍版叢書》，每種只印一二千本，不像鉛質活字，可以隨印隨拆，且沒有紙型，不易再版，所以到現在很少見到了。當時署名縷馨仙史的蔡爾康的書目序，有那麼一段：「邇日申江以聚珍版印書問世者，不下四五家，而《申報》館獨為創始，六載以來，日有搜輯，計印成五十餘種，皆從未刊行及原版業經毀失者，故問訊之人踵相接也。」蔡爾康便是叢書的主輯者。自一八七二年至一八七七年，所印成績斐然。一八七九年，尊聞閣主又有續書目的刊行。
《申報》館的印刷機
叢書以筆記雜錄為最多。屬於地方性的，如劉世馨的《粵屑》，陳樹基的《西湖拾遺》，施可齊的《閩雜記》；有關軍政的，如陳昌的《霆軍紀略》（霆軍指鮑春霆），尹耕雲的《豫軍紀略》，秦湘業的《平浙紀略》，望炊的《和約匯鈔》，李和叔的《使琉球記》，姚瑩的《東槎紀略》，曹晟的《十三日備嘗記》，這是揭露清道光間帝國主義侵略上海的一部信史。此外如張德明遊歷泰西十五國的紀錄，名《航海迷奇》，那是明代人的作品。又陳庚的《笑史》，獨逸窩退主的《笑笑錄》，兩種性質是差不多的。王昶的《春融堂雜記》，周壽昌的《思益堂日札》，戴蓮芬的《鸝砭軒質言》，王雪香的《孿史》，朱孔陽的《歷代陵寢備考》，蔡爾康的《記聞類編》，那是輯錄《申報》所刊奏折、論議、時事、雜聞、詩歌等，分為十四類，為新聞記載編印單行本的開始。用小說體裁寫的、有江日昇的《台灣外記》，張南莊的《何典》，湯世瀠的《東廂記》，這書根據《西廂記》的結束，另作十六出，的確是別開生面。此外，還有張敦復的《篤素堂文集》，王韜的《甕牖余談》，黎庶昌的《曾國藩年譜》十二卷。上述各書，十之七八與史料有關，可作學術研究的參考。
上海申報館的仿聚珍版印
《申報》館還經營上海圖書集成局，把《古今圖書集成》用活字版印行。當時外國人把這部巨著稱為「康熙百科全書」，又因為《申報》是外國人美查創辦的，有人也叫這個版本為「美查版」。此外又有《申報叢書》，從一九三三年開始，大都屬於國際形勢以及世界知識方面的，共四十多種。《申報月刊》，創刊於一九三二年，是為了紀念《申報》六十週年而印行的，由俞頌華主輯，後來又改為週刊，出至四卷十二期止。月刊社同時發行《申報月刊社叢書》，共十一種。如翁照垣的《淞滬血戰回憶錄》。瞿兌之的《杶廬所聞錄》，以及丁文江、翁文灝、曾世英編製的地圖兩種。其他出版物，有秦瘦鷗的《御香縹緲錄》，王一之的《旅美觀察談》，沈有乾的《成功百訣》，謝介子的《西方格言》，項遠村的《太平洋會議之參考資料》，以及《申報評論選》《西北視察記》《歐戰實錄》《申報上海市民手冊》《申報六十週年徵求學生文選》等。