一九六三年一月五日
《星期六晚郵報》那篇關於古巴危機的內幕報導中說，當堅尼迪總統得到了蘇聯在古巴裝置長程飛彈的情報後，立即召集要員，會商對策。當時參與最高決策的人分為兩派，大多數人主張強硬對付，立即派遣飛機，轟炸古巴的飛彈基地，或者事先發出警告，或者根本不予警告。這一派人包括中央情報局局長麥克考恩，財政部長狄龍，前任國務卿艾契遜，參謀總長泰勒，海陸空三軍的首長，以及總統的特別助理本迪。另一派人反對用空軍轟炸，主張採取海軍封鎖的辦法，這一派人包括國防部長麥克那瑪拉，總統的弟弟檢察總長羅拔·堅尼迪，杜魯門時代的國防部長羅威特，前任駐蘇大使湯姆生等。至於國務卿魯斯克，則介於強硬與緩和的兩派之間。
轟炸派的首領是艾契遜，封鎖派的首領則是羅拔·堅尼迪。這位總統的弟弟竭力反對轟炸，認為那是日本偷襲珍珠港的手段，世界輿論一定對美國不利。同時一旦轟炸，便使赫魯曉夫沒有退讓餘地，事情太過危險。艾契遜卻說，這並不是珍珠港手段，因為堅尼迪事先早已一再提出警告，美國決不容許在古巴裝置進攻性的武器。最後國防部長麥克那瑪拉的意見為大家所接受，他主張首先加以封鎖，如果赫魯曉夫不肯讓步，那麼在蘇聯的長程飛彈裝置完竣之前，再加轟炸或侵入古巴不遲。
這個最後的決策是在十月二十日（星期六）晚上決定的，當即展開海上封鎖的佈置。廿二日（星期一）晚上，堅尼迪發表演說，宣佈封鎖古巴，封鎖自廿四日上午十時開始生效。他同時組織了一個全國安全委員會的執行委員會，一共包括九人，除總統外是魯斯克、麥克那瑪拉、狄龍、羅拔·堅尼迪、泰勒、本迪、麥克考恩，以及總統的智囊索倫生。堅尼迪的演說，大部分是這個索倫生寫的。
封鎖一加宣佈，便是靜待蘇聯方面的反應。美國當局作了進行核子大戰的充分準備。這個九人執行委員會日日夜夜在白宮中開會，情緒自是十分的焦急和緊張。他們一致的這樣決定：如果蘇聯會為了古巴而進行核子大戰，那麼此時不戰，再過六個月之後仍舊會戰；與其等古巴的長程飛彈基地準備完成再攤牌，不如現在就攤牌。
決策者之中，只有美國駐聯合國大使史蒂文遜反對強硬對付蘇聯。他主張以美國在土耳其、意大利、英國的飛彈基地和古巴基地交換，主張不採軍事行動而進行政治談判。堅尼迪沒有接納他的意見，怕他在聯合國中的發言太過軟弱，特別派白宮助理舒林格起草史蒂文遜的演說稿，又從德國召回麥克洛埃（美國前任駐德高級專員），來協助在聯合國中的對蘇談判。這樣一來，史蒂文遜變成沒有了實權。