軍事行動也讓優勢等位基因跨越長距離和地理障礙。亞歷山大大帝就提供了一個突出的例子。在光輝的戎馬生涯中，他的鐵騎東進直到現在的巴基斯坦，直至他突然染病身亡。
他讓希臘人定居在中東幅員廣闊的地域，還建立了在阿富汗和巴基斯坦延續多年的希臘化王國。這些王國不僅僅影響了佛教藝術的發展，它們還傳播了等位基因。今天，在阿富汗的主體民族普什圖人身上，還存在著好些古希臘人的Y染色體。[13]同時，在普什圖人蔑視的鄰居哈扎拉人身上，我們發現成吉思汗本人傳下來的Y染色體。[14]光靠本地通婚，基因絕對無法傳播得這麼快，但是成吉思汗和亞歷山大的行為影響就可以做到這一點。
如果區域性的Y染色體變異（就我們所知並沒有特別的內在適應性優勢）能夠傳播這麼遠，其他亞歷山大時代在希臘普遍的有益突變必然也能做到。每個這樣的等位基因都有足夠的機會在今天的阿富汗廣泛分佈。那些蒙古等位基因則不一定，因為它們只傳播了相當於亞歷山大時代基因1/3的時間。在這些長距離傳播的情況下，聯繫發生得越早就越重要。同樣，大批的人口輸送會比少量遷移有更大的效應。