在存儲圖片、縮略圖、音頻和其他二進制文件時，很多應用程序都只依賴文件系統。雖然文件系統提供了對文件的快速訪問能力，但也會帶來組織混亂問題。考慮到大多數文件都限制了每個目錄的文件數，如果要保存數以百萬的文件，需要設計一套策略，將文件放入多個目錄裡。另一個難點涉及元數據，因為文件元數據仍然存儲在數據庫裡，所以想對文件及其元數據進行精確備份會極其複雜。
針對某些使用場景，直接將文件保存在數據庫裡更加合理，因為這能簡化文件的組織與備份。在MongoDB中，可以使用BSON二進制類型來保存各種二進制數據。這種數據類型與RDBMS BLOB（binary large object）類型相對應，是MongoDB提供的兩種二進制對像存儲方式的基礎。
第一種方式，每個文件一個文檔，適用於較小的二進制對象。如果要對大量縮略圖或MD5進行分類保存，那麼單一文檔二進制存儲會更簡單一些。另一方面，你可能希望保存大圖片和音頻文件。這時GridFS會是更好的選擇，它是MongoDB用於存儲任意大小二進制對象的API。下文中你會看到這兩種存儲技術的複雜示例。